培训中心

计算机辅助药物设计及分子动力学技术与应用

各有关单位:

Rosetta是一套用于模拟大分子结构的综合软件，具有灵活、多用途的应用。包括蛋白质和核酸的结构预测、设计以及重塑。Rosetta的web服务器已经运行了数十亿的结构预测和蛋白质设计模拟，研究人员利用Rosetta可以更好地了解传染病、癌症和自身免疫性疾病的治疗方法，进一步应用于包括开发疫苗、新材料、靶向蛋白粘合剂和酶设计等。

分子动力学模拟是分子模拟中最接近实验条件的模拟方法，能够从原子层面给出体系的微观演变过程，直观的展示实验现象发生的机理与规律，促使学术研究向着更高效、更经济、更有预见性的方向发展。可以解决和研究DNA的折叠和性质、蛋白与配体的识别机制、跨膜蛋白的工作机理、蛋白酶与底物的反应、蛋白与蛋白的耦合、比较野生型与突变蛋白的不同特性等。
近年来，利用高性能计算机来进行药物虚拟筛选已经被广泛应用，计算机辅助药物设计可以提高药物研发的成功率，降低研发成本，缩短研发周期，是目前创新药物研究的核心技术之一。随着医药大数据的积累和人工智能技术的发展，运用AI技术并结合大数据的精准药物设计也不断推动着创新药物的发展。
应新老客户的培训需求，特举办“计算机辅助药物设计及分子动力学技术与应用”系列专题培训班，本次培训主办方为北京软研国际信息技术研究院，承办方为互动派（北京）教育科技有限公司，具体相关事宜通知如下：

一、培训特色：

1、本次系列课程共四个专题，专题一采用北京线下授课的形式，面对面教学，与老师及时进行沟通。专题二、专题三、专题四采用在线直播的形式，所有专题均建立永不解散的课程群，长期互动答疑，学员学完后可以继续与专业老师同学交流问题，巩固学习内容，从而更好地满足学员不同方面的论文及实际科研工作需求；

2、专题一课程以Rosetta软件为基础，以实例讲授和练习为主。依次讲授Rosetta软件基础、蛋白质结构viewer、结构扰动与结构优化、蛋白质复合物预测、抗体抗原模型处理与对接、SSD和MSD设计、 CartisenDDG 突变扫描、RosettaScript开发流程、序列与结构设计、从头蛋白质设计等的操作等多个内容。
3、专题二课程以NAMD软件为基础，以实例讲授和练习为主。从MD模拟流程、恒速/恒力拉伸动力学、基于伞形抽样的自由能计算、沿着反应坐标的自由能计算到深层的NAMD在生物技术计算中的应用与材料计算中的应用等。
4、专题三课程从AMBER程序入门学会编译方法，安装自己的AMBER可执行程序开始，依次讲授研究对象模型的获取与构建-体系预处理、能量优化、分子动力学模拟结果评估、结合自由能计算、相互作用机理分析、可视化、轨迹特征获取，并对经典文献进行复现分析等。
5、专题四课程带您一步步实操学习蛋白结构分析、同源建模、虚拟筛选、分子对接（半柔性、柔性对接、蛋白-蛋白、蛋白-多肽、酶蛋白-配体、核酸-小分子、共价对接）、药效团模型、定量构效关系、碎片化药物设计、Gromacs 分子动力学模拟与结果分析，并以实例讲解与练习为主，达到即学即用效果，帮助学员系统掌握计算机辅助药物设计技术，助力学术研究；

二、时间地点：

专题一：Rosetta从头蛋白抗体设计、结构优化及在药物研发中的应用专题
2023年7月28日-7月30日  线下北京（第1天报到，授课2天）
专题二：NAMD分子动力学模拟在生物及材料计算中的应用专题
2023年8月04日-8月06日  在线直播（授课3天）
专题三：AMBER分子动力学能量优化与分析、结合自由能计算专题
2023年7月29日-7月30日  在线直播（授课2天）
2023年8月05日-8月06日  在线直播（授课2天）
专题四：CADD蛋白结构分析、虚拟筛选、分子对接（蛋白-蛋白、蛋白-多肽等）
2023年8月11日-8月13日在线直播（授课3天）
2023年8月18日-8月20日  在线直播（授课3天）

三、增值服务：

1. 凡报名学员将获得本次培训书本（或电子）教材以便提前预习及随堂电子资料；

   2. 凡报名学员将获得课程相关Windows版本软件安装指导（一年有效期）；
   3. 提供无限次回放视频：凡报名学员课程结束后可获得所学专题课程无限次回放视频；
   4. 价格优惠：（优惠活动最终解释权归主办方）
        1) 早鸟优惠：所有专题课程2023年7月10日前报名缴费均立减200元
        2) 同一人报名两个及以上专题课程可享受额外优惠（具体请咨询招生联系人）
   5. 参加培训并通过考试的学员，可以获得：北京软研国际信息技术研究院培训中心颁发的《计算机辅助药物设计与应用工程师》、《从头蛋白抗体设计及在药物研发中的应用工程师》、《分子动力学应用工程师》专业技能结业证书；

四、报名费用：（含报名费、培训费、资料费）

课程名称	原价（元）	优惠后价格（元）
Rosetta专题（两天）	3300	3100
NAMD专题（三天）	3500	3300
AMBER专题（四天）	3900	3700
CADD专题（六天）	5900	5700

费用提供用于报销的正规机打发票及盖有公章的纸质通知文件；如需开具会议费的单位请联系招生老师要会议邀请函；

五、联系方式：

联系人: 汪老师

电话：15311528186　　座机：010-56245524

Q Q : 85329991
【注】开课前一周会务组统一通知；开课前一天会将直播链接及上机账号发至您邮箱或微信。

六、缴费方式：

1、对公汇款：

户名：北京软研国际信息技术研究院

开户行：中国银行股份有限公司北京学院路支行

帐号： 331166875670

（汇款请备注信息:单位+参会人员姓名）

2、支付宝商户转账：

商户名称：互动派（北京）教育科技有限公司

2.1 支付宝转账（推荐）：

先扫描下方二维码加商家为好友后转账缴费

2.2 支付宝直接扫码转账（不需要添加好友）：

七、其它事项：

请您缴费后发送缴费截图给我单位招生老师，以便于我单位查账并及时回传汇款回执单给您，谢谢！